Exilé en France lors de la retirada, Francisco Pérez, qui était parent avec Andres Alonso Gomez, s’était installé à Lyon avec sa compagne Rosa (née à Cueva, Almeria) d’origine gitane et dont le fils aîné, Antonio Flores, participera pendant l’occupation à la Résistance avec Bartolomé Flores Cano. Francisco Pérez participa aux travaux de percement du tunnel de La Croix Rousse. Le jour de l’inauguration du tunnel, en avril 1952, son corps fut retrouvé décapité dans le tunnel. Selon de nombreux mineurs aussi bien français qu’espagnols, ce n’était pas un accident du travail : Paco Pérez aurait pu être assassiné en raison de ses activités anarchistes. Il a été inhumé au cimetière de Loyasse.