Jules Aberlin militait après guerre au groupe de Besançon de la Fédération anarchiste (5e région). Il était également membre de la tendance École émancipée du syndicat national des instituteurs (SNI). A l’été 1949 il participait au camping organisé par la FA à l’auberge de jeunesse tenue par José et Renée Salamé à l’île Sainte Marguerite, en face de Cannes. En 1950 il était avec Claude Chevey, Michel Donnet et Kleber Duval le responsable de la rubrique “école” dans le Libertaire hebdomadaire. Au début des années 1950, lors des affrontements idéologiques au sein de la FA entre les partisans de Georges Fontenis et ceux de Maurice Joyeux, des frères Lapeyre, etc. regroupés autour du bulletin L’Entente Anarchiste, il prit partie pour ces derniers et participait à la reconstruction de la FA qui éditera à partir de 1954 l’hebdomadaire Le Monde Libertaire.